针对淮河流域点源污染依然严重、面源污染及地下水污染问题日趋突出、河湖闸坝众多、水资源短缺及生态基流缺乏、部分河流与湖泊为南水北调东线主要过水通道、流域社会经济快速发展等特征,诊断淮河流域水污染防治关键问题,制定淮河流域水污染控制与治理对策;重点突破一批经济高效的点、面源污染负荷削减、毒害有机物治理、地下水污染防控及生态流域建设关键技术及集成技术,突破一批水质保障与重大水污染事故防控关键技术及集成技术,突破一批流域水污染控制与治理决策支撑关键技术。选择具有典型性和代表性的企业和子流域进行技术体系的工程示范并逐步推广,孵化产学研用合作载体,实现技术成果转化及推广应用;至2020年,分阶段、分指标实现贾鲁河、沙颍河子流域及其流域水功能达标,全面恢复流域生态系统完整性。